PDFファイルに印刷用のトンボがついている場合、InDesignファイルとページサイズが異なってしまうため、

フレームと背景画像がずれます。

事前に、Acrobatの「ページのトリミング」機能を使用して、PDFファイルのページサイズを調整してください。

※ InDesignから作成したPDFのトンボサイズのデフォルトは、13mmです。